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10xGenomics Chromium单细胞转录测序系统

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    • 一个系统,一套工作流程,强大的测序应用  10xGenomics公司推出了最新的Chromium™系统。利用上千万独特的DNA序列标记的GEMs,Chromium™系统可揭示重要的基因组信息。 1、全功能仪器10xChromiumController具有可伸缩的托盘和触屏界面,占用空间极小,不超过1平方英尺,却能够高效的将10万到100万次的移液步骤自动化,采用先进的微流控系统,高通量的对样品进行分离并带上序列标签,最终达到高通量检测的目的。10xChromiumController可以进行基因组的分析,同时可以进行单细胞水平的功能分析。 2、单细胞仪器10xChromiumSingleCellController具有可伸缩的托盘和触屏界面,占用空间极小,不超过1平方英尺,却能够高效的将10万到100万次的移液步骤自动化,采用先进的微流控系统,高通量的对样品进行分离并带上序列标签,达到高通量检测的目的。10xChromiumSingleCellController只可以进行单细胞水平的功能分析。 产品优势: 提升组装参数:结合该技术的组装效果较单独使用Illumina数据最高可提升十几倍; 测序平台通用性:应用该技术构建的文库可与Illumina测序系统完美匹配; 分子片段长:分析可将短Reads组装成长达50-100Kb的linked-reads; 单倍体分析:可实现染色体级别Phasing,获得精确的单体型信息。 技术原理: 1.将样本分配到100,000s到1000,000s微反应体系,每个微反应体系含有一种特定的DNA序列标记。 2.含有barcode信息的凝胶珠子首先与样品和酶的混合物混合,然后与位于微流体“双十字”连接中的油表面活性剂溶液结合。 3.GEMs (包含样品、酶、凝胶珠子的混合物油滴)流到储液器中并进行收集。凝胶珠子溶解释放barcode序列,开始对样本进行标记。将每个液滴中含有barcode信息的产物混合。然后构建标准测序文库。 应用方向: 1.基因组组装:利用GemCode平台对长片段序列进行扩增引入barcode序列以及测序接头引物,然后将序列打断成适合测序大小的片段进行测序,通过barcode序列信息将多个Reads进行组装,获得跨度在30-100Kb的linked-reads信息,从而获得大片段的遗传信息。 优势: 通过该技术构建的文库可与Illumina测序系统完美匹配,将短Reads组装成长达100Kb的片段; 结合该技术后组装效果较单独使用Illumina数据最高可提升十几倍; 精度高、成本低,操作难度小。 2.单细胞转录组测序:基于10x Genomics最新Chromium™系统利用油包水的微反应体系,通过序列标签区别群体中的不同细胞,获得单细胞水平的数字化基因表达谱,可实现数千甚至数万个单细胞群体分析,解决常规scRNA-seq方法在通量或扩展性方面存在的不足,为单细胞研究开拓新的思路。 优势: 超高通量:单个样本细胞检测数最高可达1000-10000; 项目周期短:一天内即完成从细胞悬液到cDNA文库构建所有的测序准备工作; 细胞捕获效率高:单个细胞捕获效率高达65%,可准确鉴别稀有细胞类型; 真正的单细胞测序:通过油滴-barcode-单细胞的对应关系,实现真正意义上的单细胞测序; 测序平台兼容度广:与Illumina各种型号的平台高度兼容。

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